Prima di diventare romana, Zara era una città appartenuta ai Liburni (tribù illirica del nord della Dalmazia). Durante alcuni scavi effettuati nella regione, sono state riportate alla luce numerose testimonianze di queste due civiltà, oggi custodite nel museo assieme ad alcune opere d'arte paleocristiana. Si ammirino in particolar modo le stele funerarie romane ed il meraviglioso pluteo in pietra con scene del vangelo (si noti la Fuga in Egitto), recuperato nella chiesa di S. Domenico.