Le vestigia di Filakopi, la Milos neolitica, sono sparpagliate sulla vicina collina, lato est. Raggruppata in frazioni, la prima capitale dell'isola e probabile antica colonia cretese fiorisce a partire dal III millennio prima di Cristo. Rivela un'organizzazione già molto evoluta. Ha prosperato per 3500 anni prima di essere distrutta dai Dori e abbandonata nell'XI sec. a.‑C. Il sito tradisce un'influenza minoica e poi micenea, nell'ultimo periodo.