La chiesa è famosa per un'importante tela di El Greco che vi è esposta: La sepoltura del conte di Orgaz. L'opera, eseguita nel 1586, riproduce il miracolo dell'apparizione di Sant'Agostino e Santo Stefano, venuti a seppellire di persona il conte di Orgaz. Il talento dell'artista emerge nei contrasti di colore e di luce che fanno risaltare i volti e le mani, e nel raccoglimento dei personaggi.