Questa antica fortezza del XVI sec., trasformata nel XVII sec. in cittadella alla Vauban, conserva un aspetto altero, con le sue alte mura e i bastioni a spigoli vivi, sormontati da garitte di vedetta. Prigione di stato fino al 1974, quindi centro di accoglienza provvisorio per i profughi provenienti dall'Angola, la cittadella di Peniche domina sia il porto a est sia il mare a sud. Nella capela Santa Bárbara un piccolo museo presenta la storia della cittadella.