A 2350 m di altitudine, il più grande lago ad altezza elevata del Nord America ha una superficie di 352 km², 177 km di rive ed è profondo circa 120 m. Anche se la superficie è ghiacciata per metà dell'anno, le aperture sul fondo fanno defluire acqua calda (fino a 122 °C). Lo Yellowstone River confluisce nel lago a sud-est ed esce a Fishing Bridge attraverso il Grand Canyon of the Yellowstone, continuando per 1080 km verso la confluenza nel fiume Missouri. E il più lungo fiume senza dighe di tutti gli Stati Uniti.