Il seminterrato della Fundação Millennium ospita delle vestigia romane. Uno spazio espositivo rievoca la storia della Baixa sin dal VII sec. e permette di osservare la stratificazione delle strutture, dagli edifici pombalini fino al livello freatico. Il sito fu occupato da una bottega di ceramiche, da una necropoli e, successivamente, da una zona di attività portuale. Da notare il mosaico del III sec. e il forno di età islamica.