L'Accademia presenta un interesse eccezionale per le sculture di Michelangelo che ospita: quattro dei Prigionieri o Schiavi destinati a ornare la tomba di papa Giulio II a Roma e una delle prime creazioni del maestro, la Pietà detta di Palestrina e, in un'abside costruita appositamente, il grande David, realizzato dall'artista tra il 1501 e il 1504, all'età di soli 25 anni. Le sale del primo piano presentano un'interessante mostra sull'arte a Firenze alla fine del periodo gotico, tra il 1370 e il 1430.