La facciata esterna della Cerosa di Miraflores è ravvivata soltanto dai pinnacoli dei contrafforti e dai due blasoni dei fondatori. L'insieme resta molto austero e contrasta con la ricchezza delle decorazioni interne, dall'unica navata alle eleganti volte a chiave dorate, e soprattutto, dell'eccezionale insieme scultoreo del coro, realizzato alla fine del XV sec. da Gil de Siloé e che comprende un retablo in legno policromo, un mausoleo reale in marmo bianco e una nicchia riccamente decorata che ospita la tomba dell'infante Alfonso.