Le collezioni del Museo di Belle Arti comprendono un'importante raccolta di dipinti che spaziano dal XII al XX sec. I temi dominanti sono la storia di Beaune o la rappresentazione del paesaggio fra il XVII e il XIX sec. Fra le opere principali, ammirate le allegorie dei quattro elementi della bottega di Brueghel dei Velluti (o il Vecchio) e la Croce vivente della fine del XIV sec. Ammirate anche le opere di Félix Ziem (1821-1911), pittore nato a Beaune e autore di paesaggi dai toni luminosi.