Sotto una cupola di vetro verde, il Florida Aquarium contiene circa 4 milioni di litri d'acqua dolce e salata che alimentano 5300 piante e animali acquatici. L'acquario ricrea diversi habitat acquatici che si possono esplorare a piacimento: Wetlands (paludi), Bays and Beaches (baie e spiagge) e Coral Reef (barriera corallina). La sezione No Bone Zone è dedicata ai molluschi, mentre Dragon Down Under ai cavallucci marini e affini.