Il Museo costeggia il bacino degli Chalutiers ed è separato in due parti che ripercorrono la storia e la vita marittima della città. La prima, il museo galleggiante, presenta navi di tutte le dimensioni, dal ketch Joshua sul quale Bernard Moitessier realizzò, nel 1968, alla prima corsa intorno al mondo in solitario senza scalo, alla France I, ultima fregata meteorologica in servizio fino al 1985. Sulla banchina, la Galerie des Pavillons ospita la mostra "La Rochelle née de la mer" e una mostra temporanea rinnovata ogni anno.