Il museo può contare su un notevole allestimento, come testimoniato dalla sezione di egittologia del 1o piano, valorizzato da una sottile illuminazione. Il piano superiore è dedicato al popolamento della regione della Malopolska (Piccola Polonia), presentato secondo un approccio tematico e cronologico, con intenti didattici. La sezione che tratta dei riti funerari è arricchita dal pezzo centrale del museo: l'obelisco in pietra scolpito su quattro facce (X sec. d.C.), chiamato Swiatowid Zbruczanski e scoperto in Ucraina nel 1848.