Nel 1997 gli archeologi scoprirono tre chiese, due pozzi e tre cisterne. Fu allora identificato con certezza il villaggio di Betania «al di là del Giordano, dove Giovanni battezzava» (Giovanni 1-28). La parte principale del sito è una collina chiamata Tell Mar Elias, da dove Elia ascese in paradiso e dove si stabilì la prima colonia di San Giovanni Battista, nel I secolo d.C. 2,7 km più a ovest si trova la seconda parte del sito con la chiesa di San Giovanni, e 300 m più avanti, il luogo del battesimo propriamente detto. Le costruzioni risalgono per la maggior parte ai secoli V e VI.