Allestito nell'antico palazzo arcivescovile (XVI sec.), il museo di Évora presenta collezioni d'arte e di archeologia. Vi si ammira in particolar modo il cenotafio (XVI sec.) del vescovo Afonso do Portugal, un bel sarcofago in marmo del 1364, alcune tele di Francisco Henriques (pittore ufficiale del re Manuele) e di Gregório Lopes, in cui si nota l'influenza del manierismo. Le raccolte comprendono anche 13 pannelli dell'antica pala d'altare fiamminga della cattedrale.