Oltre alle vestigia etrusco-romane e paleocristiane scoperte sotto la cattedrale e tutt'intorno, il museo della cattedrale possiede una bella collezione di libri religiosi miniati del Quattrocento e Cinquecento provenienti dall'abbazia di Monte Oliveto Maggiore, pezzi di oreficeria, reliquari e ornamenti sacri. Il percorso di visita del labirinto di Porsenna, antico sistema idrico, ha inizio nel museo e termina nella cisterna etrusco-romana del II-I sec. a.C.