Gli oggetti esposti in questo museo sono stati rinvenuti sull'isola, a Lilibeo (l'attuale Marsala) e nella necropoli di Birgi, sul litorale, dall'archeologo inglese Giuseppe Whitaker. Ceramiche fenice e vasi greci compongono l'essenziale delle collezioni. Il pezzo più importante è tuttavia, tra le sculture, l'Efebo di Mozia, nobile figura dal fiero portamento con un lungo abito finemente pieghettato.