Il Museo dei Manoscritti propone un'incredibile selezione dei tesori della biblioteca. Il fondo è talmente ricco che il centinaio di opere proposte sono regolarmente variate. Alcuni pezzi rari rimangono tuttavia fissi, come il fac-simile di un frammento di rotolo della biblioteca antica scoperto in una tomba del Fayyum e il cui originale è conservato in Austria. Si notino tra l'altro due grandi ricami provenienti dalla Kaaba della Mecca.