Situata in una zona pedonale del centro di Pisa, a soli 300 metri dalla Torre Pendente, la San Tommaso offre camere con aria condizionata, soffitti con travi in ​​legno e Wi-Fi gratuita. Il San Tommaso occupa un edificio storico e la maggior parte delle sistemazioni si trova al 1° piano, risalente al Settecento. La struttura sorge nei pressi di ristoranti, caffetterie e negozi.